质粒提不出和得率较低的原因
1 ) 大肠杆菌老化:
请涂布平板培养后,重新挑选新菌落进行液体培养。
2 ) 质粒拷贝数低:
由于使用低拷贝数载体引起的质粒DNA 提取量低,可更换具有相同功能的高拷贝数载体 。
3 ) 菌体中无质粒:
有些质粒本身不能在某些菌种中稳定存在,经多次转接后有可能造成质粒丢失。例如,柯斯质粒在大肠杆菌中长期保存不稳定,因此,不要频繁转接,每次接种时应接种单菌落,另外,检查筛选用抗生素使用浓度是否正确。
4 ) 碱裂解不充分:
使用过多菌体培养液,会导致菌体裂解不充分。
5 ) 吸附柱过载:
不同产品中吸附柱吸附能力不同,如果需要提取的质粒量很大,请分多次提取。
6 ) 质粒未全部溶解(尤其质粒较大时):
洗脱溶解质粒时,可适当加温或延长溶解时间。
7 ) 乙醇残留:
漂洗液洗涤后应离心尽量去除残留液体,树脂型试剂盒漂洗后应晾干树脂,再加入洗脱缓冲液。
8 ) 洗脱液加入位置不正确:
洗脱液应加在硅胶膜中心部位以确保洗脱液会wan全覆盖硅胶膜的表面达到最大洗脱效率。
9 ) 洗脱液不合适:
DNA只在低盐溶液中才能被洗脱,如,洗脱缓冲液EB(10mM Tris•Cl,pH8.5)或水。洗脱效率取决于pH值。最大洗脱效率在pH7.0~8.5间。当用水洗脱时确保其pH值在此范围内,如果pH过低可能导致洗脱量低。洗脱时将灭菌蒸馏水或洗脱缓冲液加热至60℃后使用有利于提高洗脱效率。