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  蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛，要利用不同蛋白间内在的相似性与差异，利用各种蛋白间的相似性来除去非蛋白物质的污染，而利用各蛋白质的差异将目的蛋白从其他蛋白中纯化出来。

根据蛋白质溶解度不同，蛋白质的分离纯化可分为盐析法和等电点沉淀法。盐析一般是指溶液中加入无机盐类而使溶解的物质析出的过程。如：向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后，可以降低蛋白质的溶解度，使蛋白质凝聚而从溶液中析出。这是一种物理变化，可复原。

等电点沉淀法是利用蛋白质在等电点时溶解度最/低而各种蛋白质又具有不同等电点的特点进行分离提取的方法。在等电点时，蛋白质分子以两性离子形式存在，其分子净电荷为零(即正负电荷相等)，此时蛋白质分子颗粒在溶液中因没有相同电荷的相互排斥，分子相互之间的作用力减弱，其颗粒极易碰撞、凝聚而产生沉淀，所以蛋白质在等电点时，其溶解度最小，最易形成沉淀物。等电点时的许多物理性质如黏度、膨胀性、渗透压等都变小，从而有利于悬浮液的过滤。

需要注意的是，不同的蛋白质，具有不同的等电点。在生产过程中应根据分离要求，除去目的产物之外的杂蛋白；若目的产物也是蛋白质，且等电点较高时，可先除去低于等电点的杂蛋白。同一种蛋白质在不同条件下，等电点不同。